Žrijeb parova šesnaestine finala Kupa Bosne i Hercegovine za sezonu 2025/2026 biće obavljen u utorak, 7. oktobra 2025. godine, s početkom u 12:00 sati, u prostorijama Nogometnog/Fudbalskog saveza BiH u Sarajevu.
U ovoj fazi takmičenja nastupiće 32 kluba:
FK Borac (Banja Luka), FK BSK (Banja Luka), FK Crni Vrh (Jaružani), NK Čelik (Zenica), FK Famos (Hrasnica), NK GOŠK (Gabela), OFK Gradina (Srebrenik), HNK Grude (Grude), HNK Kruševo (Kruševo), NK Jedinstvo (Bihać), FK Laktaši (Laktaši), FK Leotar (Trebinje), FK Majevica (Lopare), ŠD Napredak (Matići), HŠK Posušje (Posušje), FK Radnik (Bijeljina), FK Radnik (Hadžići), FK Romanija (Pale), FK Rudar Prijedor (Prijedor), FK Sarajevo (Sarajevo), FK Slavija (Istočno Sarajevo), FK Sloboda (Tuzla), FK Tekstilac (Derventa), NK Slatina (Bašigovci), FK Sloga Doboj (Doboj), NK Stupčanica (Olovo), NK Široki Brijeg (Široki Brijeg), FK Tuzla City (Tuzla), FK Velež (Mostar), HŠK Zrinjski (Mostar), FK Zvijezda 09 (Bijeljina) i FK Željezničar (Sarajevo).
